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I ESCUELA INTERNACIONAL DE CATÁLISIS
VII SIMPOSIO COLOMBIANO DE CATÁLISIS
VI SIMPOSIO DE QUÍMICA APLICADA

Índice General

- 1. Introducción a la linea de comandos

- 2. ADF
 
- 3. Games
    - 3.1 Energía del Sistema
    - 3.2 MCSCF
    - 3.3 DFT

Energía del sistema.


La energía total del sistema es el observable mas importante en la química cuántica ya que nos permite comparar cálculos desarrollados a través de teoría y los expermientos, entre mas nos acerquemos a esta energía mejor representado está el sistema por la teoría y el método (bases, funcionales y aproximaciones)

Hartree y Fock fueron los primeros en hacer operacional la ecuación de Shrödinger ...

 

3.1.1 Búsqueda de la multiplicidad del sistema.

  • Cree una carpeta que se llame gamess esta será la carpeta principal en este tutorial
  • Dentro cree una carpeta que se llame ejercicio1
  • Alli copiará los siguientes archivos ejer1_1eje1_2 y ejer_3.
  • Cada archivo contiene diferente multiplicidad
  • Para ejecutar los archivos debes utilizar el siguiente comando

usuario@maquina$ gms archivo 01 1 > archivo.gms &

gms es el ejecutable del programa gamess, el archivo sin la extensión es la comanda, 01 se refiere a la versión compilada que tienes  de gamess, 1 es el numero de proc que se usaran (en este taller siempre sera 1) y por último a donde se dirige la salida del cálculo.

Nota: en el ejercicio1_2 se utilizan los vectores creados en el ejer1_1, en el siguiente anexo encotraras una forma fácil de hacerlo



Figura 3.1.1

3.1.2 Optimización de la geometría

El programa gamess cuenta con una herramienta que nos permite la búsqueda de la geometría de mínima energía a través del gradiente de la energía respecto del vector posición.
Es decir que gamess hace variaciones de distancias, ángulos y ángulos dihedros; calcula la energía y la compara con la anterior hasta obtener la menor de estas.

  • Dentro de la carpeta gamess cree la carpeta ejercicio2.
  • Construya la molécula de etanol Figura 3.2.1, con el programa wxmacmolplt.
  • Construya el archivo de entrada ejer2_1.inp para la optimización de energía
  • Corra el cálculo
usuario@maquina$ gms ejer2_1 01 1 > ejer2_1.gms &
  • Terminado el cálculo para encontrar los datos de mínima energía buscar la cadena de caracteres /NSERCH

Figura 3.2.1

3.1.3 Diferencias entre ROHF y UHF

Para el caso en el cual se encuentran electrones desapareados dentro del sistema, se tienen dos métodos para calcular la energía,
  • Dentro de la carpeta gamess cree una carpeta llamada ejercicio3
  • Genere dos archivos de entrada que contengan solo un Cu.
  • Modifique el SCFTYP uno tendra ROHF y el otro UHF
  • Los archivos son ejer3_1 y ejer3_2
  • Para ejecutar los archivos debes utilizar el siguiente comando

usuario@maquina$ gms ejer3_1 01 1 > ejer3_1.gms &




Figura 3.1.3





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