Índice General
- 1. Introducción a la linea de comandos
- 2. ADF
- 3. Games - 3.1 Energía del Sistema - 3.2 MCSCF - 3.3 DFT
|
Energía del sistema.
La energía total del sistema es el observable mas importante en la
química cuántica ya que nos permite comparar cálculos desarrollados a
través de teoría y los expermientos, entre mas nos acerquemos a esta
energía mejor representado está el sistema por la teoría y el método
(bases, funcionales y aproximaciones)
Hartree y Fock fueron los primeros en hacer operacional la ecuación de Shrödinger ...
|
|
3.1.1 Búsqueda de la multiplicidad del sistema.
- Cree una carpeta que se llame gamess esta será la carpeta principal en este tutorial
-
Dentro cree una carpeta que se llame ejercicio1
-
Alli copiará los siguientes archivos ejer1_1, eje1_2 y ejer_3.
- Cada archivo contiene diferente multiplicidad
- Para ejecutar los archivos debes utilizar el siguiente comando
usuario@maquina$ gms archivo 01 1 > archivo.gms &
gms
es el ejecutable del programa gamess, el archivo sin la extensión es la
comanda, 01 se refiere a la versión compilada que tienes de gamess, 1
es el numero de proc que se usaran (en este taller siempre sera 1) y
por último a donde se dirige la salida del cálculo.
Nota: en el ejercicio1_2 se utilizan los
vectores creados en el ejer1_1, en el siguiente anexo encotraras una
forma fácil de hacerlo
|
Figura 3.1.1
|
3.1.2 Optimización de la geometría
El programa gamess cuenta con una herramienta que nos permite la
búsqueda de la geometría de mínima energía a través del gradiente de la
energía respecto del vector posición.
Es decir que gamess hace variaciones de distancias, ángulos y ángulos
dihedros; calcula la energía y la compara con la anterior hasta obtener
la menor de estas.
- Dentro de la carpeta gamess cree la carpeta ejercicio2.
- Construya la molécula de etanol Figura 3.2.1, con el programa wxmacmolplt.
- Construya el archivo de entrada ejer2_1.inp para la optimización de energía
- Corra el cálculo
usuario@maquina$ gms ejer2_1 01 1 > ejer2_1.gms &
- Terminado el cálculo para encontrar los datos de mínima energía buscar la cadena de caracteres /NSERCH
|
Figura 3.2.1
|
3.1.3 Diferencias entre ROHF y UHFPara
el caso en el cual se encuentran electrones desapareados dentro del
sistema, se tienen dos métodos para calcular la energía,
- Dentro de la carpeta gamess cree una carpeta llamada ejercicio3
- Genere dos archivos de entrada que contengan solo un Cu.
- Modifique el SCFTYP uno tendra ROHF y el otro UHF
- Los archivos son ejer3_1 y ejer3_2
- Para ejecutar los archivos debes utilizar el siguiente comando
usuario@maquina$ gms ejer3_1 01 1 > ejer3_1.gms &
|
Figura 3.1.3
|
|
|
|